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科研服务
TUMOR IMMUNE RNA SIGNATURE
贝博手机登陆网页免疫RNA检测
RNA Signature (by nCounter)

1、产品介绍:


背景:


分子层面上有两大类生物标志物,一类是DNA标志物,一类则是RNA——多基因表达情况的组合,RNA Signature,源自于基因表达谱的研究。

基因表达谱Gene Expression Profiling, GEP:代表细胞或组织基因表达情况(包括特定基因是否表达、表达丰度、不同组织、不同发育阶段以及不同生理状态下的表达差异)。通过一次性测定大量基因构建起细胞功能的总体态势图,可以从图谱中区分出正在分裂的细胞,以及细胞对于特征性治疗的反应。基因表达谱还有助于了解疾病的发病机制、药物的生理反应和治疗效果。

而RNA Signature是一种特定的GEP组合,通常是在科学研究或临床实验中发现的,是某一类细胞或组织中具有独特表达模式的单基因或多基因集合,通常与细胞或组织的生理过程以及病变状态相关。RNA Signatures常用于疾病诊断、分型、疗效预测或预后预测。显示出了生物标志物的特性。

 

服务内容:


RNA检测(by nCounter)以及相关信息分析


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检测平台:nCOUNTER SPRINT


Nanostring nCounter Sprint为800多个目标基因表达的检测提供了一种高效的自动化解决方案,且具备良好的准确度、精密度。

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检测技术优势:


√ qPCR的准确性

√ RNA-Seq的通量

√操作便捷性

√ 样本友好-FFPE、新鲜样本

√ 精密度极高:批间差、室间差小

√无逆转录和PCR带来的系统性偏差

√看家基因:归一化分析

 

性能


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检测技术路线:液相杂交技术


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实验工作流程


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分析内容


a. Fastq数据质控

b. 数据比对质控

c. mRNA表达定量分析

d. mRNA表达聚类分析

e. 样本间相关性分析

f. mRNA差异表达分析

g. 差异表达基因功能富集分析

h. 免疫相关Signature分析

i. 免疫微环境分析

j. 贝博手机登陆网页炎症特征分析

k. 可变剪接分析

l. SNV/InDel分析

m. 融合基因分析


应用领域

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贝博手机登陆网页免疫领域举例:


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样本类型/要求

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服务类型

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RNA Signature价值举例

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